甘肃太子山国家级自然保护区位于临夏回族自治州与甘南藏族自治州之间，东南起洮河下游地区，西南与甘南州临潭、夏河、合作、卓尼四县（市）及青海省循化县毗邻，东北和临夏州康乐、和政、临夏、积石山四县相接。东西长约100公里，南北宽约10公里。保护区总面积127万亩。

 保护区前身为临夏州太子山总场，建场于1957年；1991年更名为“临夏回族自治州太子山水源涵养林建设总场”；2001年12月，甘肃省政府决定将太子山林区移交省林业厅直属管理，2002年7月，省政府颁发了林权证；2003年9月，太子山自然保护区管理局挂牌成立；2005年12月，批准为省级自然保护区；2012年1月由国务院办公厅确定为国家级自然保护区，2021年5月更名为甘肃太子山国家级自然保护区管护中心。

保护区管护中心为县级事业单位，内设13个科室，4个基层机构，下辖紫沟、东湾、药水、松鸣岩、大滩、新营、甲滩、关滩8个保护站，设立了42个保护段（点）。管护中心实行中心站段三级管理体系,现有职工381人。

保护区属于自然生态系统类别——森林生态系统类型自然保护区。保护区生物多样性十分丰富，稀有性显著，据考察，有维管植物 98 科 359 属 839 种 33 变种 1 亚种 3 变型，包含引种栽培类群 1 科 4 属 8 种；有脊椎动物27目68科262种，其中鱼类1目2科10种，两栖类2目4科5种，爬行类2目2科3种，鸟类16目42科177种，兽类6目18科67种；保护区内有昆虫13目131科507属682种（包括国家保护珍稀濒危昆虫1种，甘肃记录种30余种），其中有天敌有益昆虫7目41科113属151种。

保护区属温带大陆性气候，年平均气温5.1℃，无霜期110天左右，年平均降雨量660毫米。保护区海拔在2200—4332米之间，主要由太子山脉发源而来的一系列山峰和沟谷组成，其中海拔超过4000米以上的山峰有：巴楞山（4080米）、公太子山（4162米）、母太子山（4332米）等。从东向西纵布着近30条峡谷，每条山谷间都有河（溪）流流淌:据统计，发源于保护区的大小河（溪）流近200多条，其中较大的河流有16条。境内山、水、林、湖、草与周边农田，组合成一幅生命共同体相依相存的画卷。

长期以来，管护中心致力于自然保护区保护、管理和发展，坚持不懈推进退耕还林、天然林保护、三北防护林体系等林业生态工程建设及国家重点公益林建设，持续恢复扩大森林资源，森林覆盖率达到32.16%，有林地面积由12万亩增加到36.8万亩，活立木总蓄积由11万立方米增加到36.4万立方米，实现了森林资源面积和蓄积的双增长。区内生物多样性大幅度增加，已造就一片甘肃省中南部地区最大的天然林基地。特别突出的是，这片绿色宝地除了稳定地发挥森林调节气候、防风固沙、减碳贮氧等功能外，她所涵养的水源，满足了药水、大湾滩、太子山水库等大型水库备用水源，供给了临夏州200多万人民群众的生活用水和灌溉用水。因此，太子山国家级自然保护区是临夏州乃至甘肃省中南部地区重要的生态安全屏障。